در 7 ژوئن 1970 و در زمانی که گرد مولر در جام جهانی 1970 در مقابل بلغارستان هتریک کرد، شاید کمتر کسی عکس ویلهلم نویدکر(رئیس وقت باشگاه بایرن مونیخ) در کنار بازیکنان بانوان بایرن مونیخ در هنگام تاسیس تیم بانوان را به یاد داشته باشد. 
فدراسيون فوتبال آلمان در سال 1955 هرگونه فعالیت در فوتبال بانوان را ممنوع اعلام کرد و معتقد بود که این ورزش به زنان آسیب میرساند. این امر تا سال 1967 به طول انجامید تا اینکه باواریایی ها تصمیم به تشکیل یک تیم بانوان گرفتند، در حالی که آنها به صورت مخفیانه به کار خود ادامه میدادند. بعد از تاسیس تیم بانوان در 1970 بازهم خبری از بازی های رسمی نبود ولی بانوان بایرن هم کم نمی آوردند و همچنان سخت تلاش میکردند و در کمپ های تمرینی حضور پیدا میکردند و بازی های دوستانه انجام میدادند،حتی آن ها در همان سال ها مقابل تیم ملی بانوان ایتالیا یک بازی دوستانه برگزار کردند که با نتیجه 2 بر 1 هم پیروز شدند. 
 بالاخره وقتش فرارسید. درسال 1972 و با تصمیم فدراسیون فوتبال آلمان قرار شد اولین دوره رقابت های قهرمانی بانوان آلمان برگزار شود. 
 قبل از برگزاری مسابقات قهرمانی بانوان آلمان، تیم بانوان بایرن مونیخ در سال 1972به مقام قهرمانی منطقه باواریا دست یافت، افتخاری که 20 بار دیگر تکرار شد. 
 بعد از مدتها تلاش بالاخره تیم بانوان بایرن مونیخ به حقش رسید و در سال 1976 برای نخستین بار فاتح رقابت های بانوان آلمان شد. بایرن در سال 1979 نیز به فینال این رقابت ها رسید ولی در نهایت بازی را واگذار کردند. 
 دهه 80 و 90 دهه عجیب و پر فراز و نشیب، برای تیم بانوان بود. آنها در سال 1988 و 1990 دوبار به فینال جام حذفی بانوان آلمان رسیدند که هر دو مرتبه نتیجه را واگذار کردند.
آلمان ها تصمیم به راه انداختن بوندسلیگای بانوان را گرفتند که یکی از عوامل تشکیل آن، تیم بانوان بایرن مونیخ بود.
آنها در فصل اول 1990/91 در منطقه جنوب آلمان چهارم شدند و برای فصل بعد به بوندسلیگای 2 سقوط کردند.
8 سال طول کشید تا درسال 2000 آنها دوباره به بوندسلیگا برگشتند. یکی از عوامل اصلی آن تحت تاثیر قرار گرفتن فرانتس بکن بائر (رئیس وقت باشگاه) از جام جهانی زنان 1999 بود. بکن بائر بعد از جام جهانی 1999 بانوان تصمیم گرفت درآمد سالانه تیم بانوان را از 50000 به 300000 فرانک سوئیس افزایش دهد که این امر باعث شد تا آنها بازیکنان جوانی از جمله نادین آنگرر، وورل و پترا ویمبرسکی که سال ها بعد به ستارگان تیم ملی بانوان آلمان تبدیل شدند را بخرد.
در فصل 2008/09 شرایط به شکل عجیبی رقم خورد. امتیاز تیم بانوان بایرن مونیخ با تیم پوتسدام در عدد 54 برابر بود و تنها به خاطر یک گل کمتر در جایگاه دوم قرارگرفتند و برای اولین بار سهمیه پلی آف لیگ قهرمانان زنان اروپا را گرفتند. 
 تا فصل 2011/12 همه چیز عادی بود، ولی در پایان این فصل تیم بانوان بایرن مونیخ با پیروزی 2 بر 0 در برابر فرانکفورت بعد از سال ها به یک جام رسید و برای نخستین بار قهرمان جام حذفی بانوان آلمان شد.
 بعد از سال ها حسرت، بالاخره زمانش فرارسیده بود، در فصل 2014/15 حسرت 39 ساله به پایان رسید و تیم بانوان بایرن به مقتدراته ترین شکل ممکن و حتی بدون یک شکست، به قهرمانی بوندسلیگای بانوان دست یافت.
تیم حالا به آنچه که سال ها لیاقتش را داشت رسیده بود. چه چیزی؟ جشن گرفتن قهرمانی بوندسلیگای بانوان، آن هم در کنار آقایان و در بالکن معروف شهر مونیخ.بدین ترتیب بعد از 6 فصل تیم بانوان دوباره، سهمیه حضور در لیگ قهرمانان زنان اروپا را به دست آورد.
 در فصل 2015/16 بازهم تیم بانوان بایرن مونیخ بود که بالاتر از بانوان وولفسبورگ قرار گرفتند و به عنوان قهرمانی بوندسلیگای بانوان دست یافتند.این بار آن ها خودشان به بالکن شهر مونیخ رفتند. وقهرمانی شان را قدرتمندانه جشن گرفتند. 
 دیگر قهرمانی در بوندسلیگای بانوان به کاری ساده تبدیل شده بود، قدم بعدی موفقیت در اروپا بود. در فصل 2016/17 و در سومین فصل حضور تیم بانوان در لیگ قهرمانان زنان اروپا، دست به کار بزرگی زدند و برای اولین بار درتاریخ فوتبال بانوان باشگاه به مرحله 1/4 نهایی صعود کردند. با اینکه در بازی رفت با یک گل پاریسن ژرمن را در خانه شکست دادند ولی در بازی برگشت بازی را واگذار کردند و از صعود به نیمه نهایی بازماندند. این افتخاری در تاریخ باشگاه بود،چون این را میتوان از چهره ی اولی هونس رئیس وقت باشگاه بایرن مونیخ فهمید او با پیراهنی که از نام هشتگ یک چهارم نهایی در آن نوشته شده بود در کنار دو نفر از بازیکنان عکس یادگاری انداخت. 
 موفقیت پشت موفقیت، اولین صعود تیم بانوان بایرن مونیخ به مرحله نیمه نهایی لیگ قهرمانان زنان اروپا در فصل 2018/19 رقم خورد. 
 در شروع فصل 2019/20 و به دلیل حمایت از فوتبال بانوان مسابقات دوستانه جام امارات برای اولین بار در قسمت بانوان، نیز برگزار شد. و تیم بانوان بایرن مونیخ با پیروزی در برابر بانوان آرسنال فاتح این جام شد.
واقعا دور از ذهن نیست که با این پیشرفت ها بتوان گفت تیم بانوان بایرن مونیخ به زودی میتواند، حتی قهرمان اروپا شود و مثل تیم مردان هر سال سینی قهرمانی بوندسلیگای بانوان را به موزه پرافتخار این باشگاه بیاورند.
